Скандал с разбита престъпна групировка в Крит, която според полицията контролирала наркотици, оръжие и изнудвания, има и църковни измерения. В центъра на вниманието се оказа и църковната тема и по-специално злоупотребата с църковни имоти. Тази тема съвпадна и с избора на нов митрополит на овдовялата катедра на Кидония и Апокорона. В центъра на дебатите се оказа и местно църковно лице - архимандрит Мелхиседек, духовник с амбиции да бъде избран за митрополит Кидония и Апокорона, който според разследването е получил подкрепа от подземния свят.
От материалите на полицията става ясно, че двама братя-хотелиери, посочвани като ръководители на престъпната организация, са развили близки отношения с архимандрита. Същите двама братя се свързват и с продажбата на 175 декара земя на манастира „Света Троица“ край Хания на чуждестранни инвеститори за над 1,5 млн. евро. За мафията изборът на „свой човек“ за митрополит на Хания би означавал пряк контрол върху огромната църковна собственост и възможност за легитимиране на спорни сделки с манастирски имоти.
Особено внимание в гръцките медии е отделено на информацията на подслушан разговор, в който единият от двамата братя лобира пред бивш военен министър на Гърция, Панос Каменос, за кандидатурата на архим. Мелхиседек за овдовялата катедра на Кидония и Апокорона. Според събеседника на министъра, кандидатурата на архим. Мелхиседек се подкрепяла от Вселенската патриаршия, от „американския фактор“, включително по линия на военната база в Суда и към нея бил благоразположен "самият Доналд Тръмп".
Особено впечатление прави твърдението, че като условие за подкрепа били поискани не пари, а св. мощи. Посредници настояли архимандрит Мелхиседек да предаде частица от мощите на свети Лазар. Самият той в разговор уверявал, че притежава такъв реликварий, а дори споменавал и за малко парче от Честния Кръст, получено чрез патриаршията. Днес Китийският митр. Нектарий, в чиято епархия е Ларнака, където се пазят мощите на св. Лазар, отрече те да са отваряни и да е предавана частица от тях, поне докато той е митрополит от 2019 г.
По същото време патриарх Вартоломей, под чиято юрисдикция е Критската църква, според източници, упражнявал натиск върху гръцкото Министерство на образованието и вероизповеданията, за да бъде блокирана кандидатурата на друг претендент за поста, Кисамски митр. Амфилохий. Според твърдения на Вселенската патриаршия действащ митрополит не може да бъде преместен на нова катедра, но трябва да остане в тази, в която е ръкоположен. В интерес на истината обаче трябва да кажем, че това не се спазва от самата патриаршия и ето само някои примери от последните десетилетия: патриаршията с решение на синода си премести своя митрополит за Франция Йеремия в Швейцария, а сетне - в Анкара (с древното име Анкира); наследилия го в Париж митрополит Емануил патриаршията по-късно премести в истанбулския квартал Кадъкьой, където в древност е бил прочутият Халкидон; митрополита на Пруса (Бурса, Турция) Елпидофор пък направи американски архиепископ.
Тъй като Кисамският митр. Амфилохий обаче открито е настоявал за връщане на незаконно заграбената църковна земя, то медиите оценяват кандидатурата му като антипод на тази на архим. Мелхиседек, чието име не е включено в листата на достоизбираемите.
Архим. Мелхиседек също говори пред гръцките медии. Според него той е оклеветен, общувал е с двамата братя-хотелиери, без да знае за тяхната престъпна дейност, само доколкото те са енориаши на местния храм и не е търсел тяхната подкрепа, за да бъде издигнат на овдовелия престол. Той е живял 17 години на друго място и се е върнал тук, където е роден, едва преди две години и затова няма общо със случая с продадената манастирска земя, който е от 2017 г. Тогава, според разследващите, компрометиран архимендрит (игумен на манастира, вече низвергнат), от манастира "Св. Троица", е подписал след изнудване документ, според който въпросните 175 декара не са манастирска собвственост, в резултат на което те са продадени на израелски инвеститори.
Според архим. Мелхиседек скандалът се използва, за да се внесе напрежение между Вселенската патриаршия и Критската църква.
