Сливенският митрополит Йоаникий, който почина на 9 януари, беше погребан в двора на катедралния храм „Св. Димитър“ в престолния град на епархията. Заупокойната св. Литургия и опелото на архиерея оглави Варненски и Великопреславски митрополит Йоан, който беше определен от Св. Синод за наместник на овдовелия митрополитски престол.
Преди това на 10 януари вечерта в храм „Св. Димитър“ в Сливен Агатополски епископ Йеротей, досегашен викарий на Сливенския митрополит, отслужи монашеско опело на митр. Йоаникий. В него взеха участие и свещенослужители от гр. Сливен и епархията.
Хиляди жители на епархията се стекоха в катедралния храм, за да се простят със своя архиерей.
На 11 януари митр. Йоан извърши заупокойната св. Литургия и опелото на новопреставения владика. В съслужение с него бяха събратята му митрополитите Великотърновски Григорий, Ловчански Гавриил, Неврокопски Серафим, Русенски Наум, Старозагорски Киприан, Врачански Григорий, Видински Даниил, Доростолски Яков, както и епископите Мелнишки Герасим, главен секретар на Св. Синод, Браницки Пахомий, ректор на Софийската духовна семинария, Агатополски Йеротей, Главиницки Макарий, викарий на Русенския митрополит, а също и свещенослужители от Сливенска епархия и дякони от София.
Песнопенията на заупокойните богослужения бяха изпълнени от хор под ръководството на йером. Юстин Зографски.
В края опелото Великотърновски митрополит Григорий, като старши член на Св. Синод, прочете слово от името на Негово Светейшество Българския патриарх Неофит и Св. Синод на БПЦ, в което каза: „За нас и за неговите духовни чеда, както и за цялата ни света Православна църква отшествието му от земния живот е тежка загуба. Днес оставаме със спомена за неговата благост, пословичната му любов към Бога и светата Църква и всеотдайността му в делото на Благовестието… В тези скръбни дни молим Всеблагия Бог да му прости всяко волно и неволно прегрешение, да го приеме при Себе Си, да му въздаде за трудовете и да му дарува вечен покой… Ще го помним винаги като изряден архипастир, високодуховен архиерей, ревнител за единството на Църквата, за духовността и църковната просвета, вглъбен в истините на вярата богослов и преводач на безценни аскетически трудове от богатата съкровищница на светоотеческото наследство, всякога готов с радост да насърчи и подкрепи всяко добро и полезно начинание. Дълголетното му служение като архипастир в Сливенска епархия и плодовете от неговия труд го поставят редом с имената на най-големите архиереи от най-новата история на Православната ни църква“.
С кратки слова за личността и делото на митр. Йоаникий се обърнаха към богомолците кметът на Сливен Стефан Радев и кметът на Бургас Димитър Николов. Те определиха като плодотворно общуването си с владиката, който за тях остава като пример за духовен човек и мъдър архипастир.
След това с лития духовници и миряни се отправиха към източната страна на катедралния храм „Св. Димитър“, където митр. Йоаникий беше погребан.
След погребението на владиката временно управляващият епархията митр. Йоан започва подготовката за избор на нов епархийски архиерей на Сливенска епархия. Предстои да бъде изготвен и одобрен списък с достоизбираемите епископи за този пост.
