На 11 септември 2004 г. църковна делегация, водена от Александрийския и на цяла Африка патриарх Петър VII, катастрофира с военен хеликоптер на път за Света Гора. Обстоятелствата около трагичното събитие остават неизяснени. Тези дни гръцки медии публикуваха таен доклад за трагичното събитие, информацията от който досега не е била известна не само на обществеността, но е била спестена и в официалните доклади на военно-въздушните сили.
На фаталната дата висшата 17-членна църковна делегация е пътувала до Света Гора с хеликоптера „Chinook CH-47D” на гръцките военно-въздушни сили. През този период Гърция живее под знака на олимпийските игри и мерките за сигурност са били на най-високо ниво. Освен гръцките служби за сигурността на игрите допринасят и службите на САЩ и Великобритания. Военният хеликоптер, превозващ Александрийския патриарх, е трябвало да лети на определена височина, да ползва определени кодове за разпознаване на полета. В публикувания таен доклад се казва, че пътниците не са били проверявани изобщо, въпреки мерките за сигурност, както и техният багаж. В 10:53 ч. пилотът изпраща сигнал, че започва приземяване на площадката за хеликоптери в Карея, Света Гора, след което сигналът изчезва. Това дава основание на контролните служби да обявят полета за приключил, смятайки, че се е приземил успешно. Чак в 12:30 ч. става ясно, че хеликоптерът с Патриарха не е стигнал до крайната си цел.
В публикувания доклад, който повдигна отново въпросителните относно фаталния полет, се казва, че докато е летял хеликоптерът на гръцките военно-въздушни сили е променил кодовете си от IFF 5001-5002 на IFF 0001, което съответства на турско летателно средство. Именно този момент е засекретен и не получава гласност в официалните доклади. Гръцки специалисти коментират в медиите различни хипотези за това необяснимо решение на екипажа, като някои предполагат, че по този начин пилотите са направили последен опит да привлекат вниманието на военно-въздушния контрол, който би трябвало да улови „вражеските кодове”. Това обаче не се случва. И досега обстоятелствата около катастрофата остават неизяснени.
