Преди 1633 години в този храм се провели заседанията на един от най-важните събори в историята на християнството – Втория вселенски събор, приел текста на Символа на вярата такъв, какъвто го познаваме до наши дни (първите членове са приети на Първия вселенски събор в Никея през 325 г. и затова символът се нарича още „Никео-Константинополски”). Църквата „Св. Ирина” е построена от имп. Константин Велики на мястото на езически храм на Афродита. В украсата на храма личат следи от иконоборческия период, тъй като над апсидата е изобразен единствено кръст, запазен и до днес.
Разрушена е по време на въстанието Ника в Константинопол през 6 в., след което е построена в още по-величествен вид от св. Юстиниан Велики. След щетите, нанесени от голямото земетресение през 740 г., тя е възстановена от имп. Константин V. Днес най-ниските части от храма са от юстиниановия градеж, а надстройката е от периода след земетресението. Храмът е забележителен пример за ранновизантийската архитектура.
През 2016 г. тук ще се проведе Всеправославният събор, който по своята същност е първият Велик събор на Православните църкви след схизмата с Римокатолическата църква през 11 в. След завладяването на Константинопол църквата „Св. Ирина” е пощадена – тя никога не се превръща в джамия. Днес функционира като музей и поради добрата акустика в нея се провеждат концерти.