Митрополитът на Дебърско-Кичевската епархия Тимотей, говорител на Св. Синод на Македонската църква, коментира решението на Сръбската патриаршия да започне църковно дело срещу предстоятеля на Македонската църква архиепископ Стефан. Той заяви, че „през 1959 г. епархиите в социалистическа република Македония се обособяват в отделна автономна Църква, която се ръководи от собствен устав и оттам нататък решенията и уставът на СПЦ повече не важат на територията на Македония”. През 1959 г. Македонската църква получава автономия от СПЦ, а през 1967 г. обявява автокефалност, която не е призната от Сръбската патриаршия. Поради тази причина оттогава до днес тя пребивава в схизма.
Решението на Сръбската патриаршия се коментира широко в македонските медии. Според професора по философия на религиите Любомир Цуцуловски, цитиран от „Утрински весник”, решението за църковен съд срещу архиепископ Стефан няма да доведе до подобряване на отношенията между двете църкви, а напротив, до тяхното влошаване. Той твърди, че спорът между Македонската и Сръбската църкви има политически характер, а не верови.
Междувременно стана ясно, че Сръбският патриарх Ириней е уведомил Вселенския патриарх Вартоломей и Московския патриарх Кирил за решението на сръбския Св. Синод да започне църковно дело срещу архиепископ Стефан за „упоритото пребиваване в разкол”. На 26 август, когато сръбските архиереи взеха това решение, на официално посещение в Белград бе и Волоколамският митр. Иларион (Алфеев), който също е бил уведомен за решението на СПЦ да съди и най-вероятно отлъчи архиепископ Стефан.
Сръбската патриаршия поставя като условие за възобновяване на диалога с Македонската църква освобождаването от затвора на архиепископ Йоан (Вранишковски) и придържането към Нишкото споразумение от 2002 г.
